Es uno de los pioneros en la implementación de Seis Sigma en México. Inició con la implementación de Seis Sigma en México desde el año 1997 en la empresa Mabe. Mabe es una empresa líder en el negocio de los electrodomésticos en México y Sudamérica.
El origen de la implementación de Seis Sigma en Mabe está íntimamente ligado con la unión estratégica Mabe y General Electric. Este último considerado quizá el máximo exponente de Seis Sigma en el mundo.
Eduardo Peña tiene también el reconocimiento de haber liderado los esfuerzos de implementación de Seis Sigma para procesos administrativos, Diseño para Seis Sigma, Confiabilidad y Lean Seis Sigma entre otros.
Recientemente Eduardo Peña se jubiló de Mabe-GE y actualmente presta sus servicios como consultor de mejora continua Lean Seis Sigma a todo tipo de instituciones y empresas, tanto en el ramo administrativo como en el de la transformación, incluyendo empresas enfocadas a la manufactura de productos.